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格林伯格接话。
“对。
我们换成了‘反演’。”
林允宁的思路很清晰，“我们不再关心它‘将要去哪，而是根据它‘最终在哪’，来反推它‘最可能从哪来。”
他看着格林伯格的眼睛，用了一个更精确的比喻。
“这本质上是一个信息重构问题。
我们手里有几万张分辨率极高的‘藏宝图碎片，也就是处理过后的冷冻电镜图像。
“我的算法，就是一套寻找‘最经济的拼接方式’的规则。
“它会不断尝试各种拼接的可能性，每拼接一块，就计算一次当前这幅画的‘信息熵，或者说‘混乱程度”
。
然后，它会永远选择让整幅画变得更清晰，更符合物理规律的那一种拼接方案。”
格林伯格静静地听着，脸上的表情从审视，慢慢变成了凝重。
他追问了一个核心问题:
“你怎么定义更符合物理规律?这是关键。
否则，你的算法只会给你一条数学上最漂亮，但生物学上毫无意义的曲线。
“我们用了两个强约束，”
林允宁回答，“第一，路径在能量上必须是连续下降的，不能凭空翻越无法逾越的能垒。
“第二，路径上的每一个中间态，它的二维投影，必须能在您那几万张实验图像中，找到统计意义上高度相似的匹配。
“我们用实验数据，给这个数学模型，制定了一个‘罗盘。”
话音落下。
办公室里陷入了长久的沉默。
格林伯格没有说话，他只是摘下眼镜，用指节用力按压着眉心。
他站起身，在巨大的落地窗前踱步，然后猛地转过身，眼神里是一种林允宁从未见过的、混杂着震惊与兴奋的光芒。
“把你的电脑连上投影。”
他用不容置疑的语气说道。
林允宁将笔记本接上投影仪，屏幕上出现了那条穿越了上千个数据点的红色轨迹。
“很好”
格林伯格走到屏幕前，指着轨迹中间那个突兀的“尖峰”
，“把这个过渡态结构，单独渲染出来。”
林允宁敲了几个命令，那个结构极其扭曲的蛋白质三维模型，出现在幕布上。
格林伯格死死地盯着那个模型，像是要把它的每一个原子都看穿。
他快步走回办公桌，打开电脑，在GoogleScholar里飞快地输入了几个关键词。
很快，一篇刚刚在线发表在《细胞》Cell上的论文被他调了出来。
他将其中一张插图放大，拖到屏幕的左侧。
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