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可1938年11月底入学后，他发现自己对物理学更有兴趣，又转到了物理学系。
联大1938年入校的新生里，16岁的杨振宁，是同学中年龄最小的一个。
此时的西南联大，学生宿舍是土墙茅草房或土墙铁皮房，教室是铁皮顶的房子，下雨时会丁丁东东响个不停。
教室的地面是泥土地，没过多久就变得七坑八洼。
窗户没有玻璃，风吹时必须用东西把纸张压住，否则会被吹掉下来。
听课坐的是在椅子右边安上一块形似火腿却只能放一本书的木板的“火腿椅”
。
但师生们苦中作乐，幽默地称吃的掺带谷子、稗子、沙子的糙米饭是“八宝饭”
，穿的通了底的鞋是“脚踏实地”
，前后都破洞的鞋是“空前绝后”
。
西南联大在学制和课程编制上，采取“学分制”
为主体的“共同必修课”
和“选修课”
三者结合的制度。
大学本科四年，必须学满130—140个学分（各系不完全一样），经考试合格（任何一科都不准补考）才能毕业，因而不少学生考取联大却读不到毕业。
在联大接受过教育的8000余人中，正式毕业生只有2522人（休学、参军者不计在内）。
到1942年7月毕业时，联大物理学系最终完成学业者只有9人。
杨振宁本科毕业获理学学士学位后，考入本校研究院理科研究所物理学部读研究生。
读研究生期间，杨振宁住在联大昆中北院研究生宿舍。
这栋宿舍是年久失修的二层小楼。
与他同室居住的有凌宁、金启华和顾震潮，黄昆和张守廉也偶尔来住几天。
这些中华民族未来的精英们聚于一起，在陋室里交谈切磋，结伴探索着科学的奥秘。
不过，杨振宁在读时的物理学系和物理学部，教授们虽想方设法办起了普通物理、电学、光学、无线电、近代物理等5个实验室，但由于缺乏仪器，实验不足，研究工作只好偏重于理论方面，教师们的研究成果也大多限于理论上的探讨。
杨振宁在联大短短的6年，却对他的一生产生了巨大的影响。
杨振宁于《读书教学四十年》中回忆说：“我在联大读书的时候，尤其是后来两年念研究院的时候，渐渐地能欣赏一些物理学家的研究风格。”
“西南联大是中国最好的大学之一。
我在那里受到了良好的大学本科教育，也是在那里受到了同样良好的研究生教育。”
“我在物理学里的爱憎主要是在该大学度过的6年时间里（1938—1944）培养起来的。”
杨门长子
杨振宁考入联大后，全家七口仅靠父亲一人挣工资养家糊口，生活过得十分艰难。
1939年9月28日，日本飞机首次轰炸昆明。
其后至1941年底，联大师生和其他昆明人一样，在“疲劳轰炸”
下三天两头就要跑警报，有时一天要跑两次。
1940年9月30日，日机又来轰炸昆明，杨家在小东角城租赁的房屋正中一弹，被炸得徒有四壁，全家少得可怜的家当顷刻之间化为灰烬。
万幸的是，家人此时都躲进了防空洞，才免除了灾祸。
可这次轰炸，对杨家的生活来说，无异于雪上加霜。
几天后，杨振宁拿了把铁锹回去，翻挖半天，才从废墟里挖出几本压得歪歪斜斜但仍可使用的书，他如获至宝，欣喜若狂。
其后，为躲避日机轰炸，他们全家搬到昆明西北郊十余公里外的龙院村惠家大院居住，且一住3年。
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