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当英国的清教徒将欧洲高等教育带到美国的时候，他们同时带来了欧洲高等教育学术自由的传统，而且，在早期，美国高校中的学术自由与欧洲高校一样，在一定程度上受到宗教组织的限制。
美国1787年宪法、1791年宪法修正案，以及以后的宪法修正案，都无明确保护学术自由的条款，这使得美国对学术自由的保护，与对公民其他自由权利的保护相比，显得相当滞后。
事实上，直到20世纪初，解聘或拒绝聘任一些被认为在经济或社会问题上的观点过于激进或有破坏性的教授的事件，在那些著名的大学，也会时常出现。
然而，也是在20世纪，美国对学术自由的保护获得了巨大的发展，美国大学教授联合会（AmeriAssoofUyProfessors，简称AAUP）对此功不可没。
AAUP成立于1915年。
这一年，AAUP召集一个资深学者委员会，这个委员会发表了一份“关于学术自由和终身教职的原则宣言”
，这份“宣言”
被认为是学术自由在美国的正式起源。
“宣言”
将学术自由看作大学满足增长人类知识和培养专门人才的公共需要的必要条件。
宣言的起草者将大学理解为知识分子的集合体，在这里新思想开花结果，在它的果实还没有成熟的时候，可能是非常苦涩的，但是，它的成熟的果实可能成为可以为公众接受的精神食粮。
“宣言”
坚持，一所大学必须准备容忍关于有争议的问题的广泛的观点，必须准备容忍它的职员的奇谈怪论。
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1940年AAUP发表一份“关于学术自由和终身职的原则声明”
（StatementofPriniandTenure），这份声明“旨在促进公众对学术自由和终身职的理解和支持以及对高校确保它们的办法的赞同”
。
“声明”
指出：
高校不能只追求教师个人或学校本身的利益，而应为共同的利益服务。
这个共同利益依赖于对真理的自由探索和解释。
学术自由是这些目的的基础，且应用于教学和研究。
自由研究对真理的发展而言十分重要；而学术自由在教学中应用的重要性主要表现在保护教师的教学权利和学生自由学习的权利方面。
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这份“声明”
是美国学术自由保护事业中的一个非常重要的文献，不仅所有学术机构和许多大学把它作为保护教师学术自由的共同法则，它甚至具有法律一般的性质，事实上，联邦最高法院的许多判例及较低级法院数不清的判例也以此为依据。
在实践和行动中，学术自由仍然经常受到挑战。
最大挑战出现在20世纪50年代早期到中期的麦卡锡（JosephA.McCarthy）时代，这个时代的所谓“忠诚宣誓”
臭名昭著。
为阻止共产主义思想的渗透，美国国会通过法律，要求公务员和大学教授签署效忠美国政府的文件。
当时美国校园有69名教授因拒绝宣誓效忠而被迫离职，其中单是加州大学就有36名。
[22]许多教授（包括电影作家、演员，以及其他领域的人员）被联邦或州的反颠覆调查所传唤。
经常并没有证据表明调查对象有实际行动，更不用说实际成为一个共产主义者了，就是因为这些人不友好，或者与共产主义者或前卫团体在一起工作，甚至仅仅是与他们偶然接触。
麦卡锡时代，有近170位终身教授和有望获得终身教授的教师被解聘，多数原因被怀疑有无据可查的不忠诚。
[23]由于风险过大，公众过于紧张，势力太大，即使最著名和最讲原则的学术机构，也不能完全承受巨大的压力。
在哈佛、密歇根，以及其他顶尖的研究型大学的历史中，都免不了有给学术职业带来很大伤害的若非投降即是妥协的事件。
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