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“你看。”
林允宁没回答，他俯下身，一杆大力开球。
“砰”
的一声闷响，白球撞入球堆，彩球四散开来，滚向桌面各处，最终停在不同的位置。
“这就是我们之前在做的事，”
林允宁直起身，用球杆指了指桌面上混乱的彩球，“我们想通过观察这些球最终停在哪，来反推出开球时，白球的速度和角度。
这是‘观相’。”
他走到桌边，把所有彩球重新摆回三角形。
“但我们忽略了一点，”
他再次俯身，这一次，他用了一个完全不同的角度和力道，轻轻一推。
白球慢悠悠地滚过去，踏开球堆，彩球们互相碰撞，走出了完全不同的轨迹，最终停在了另一组位置上。
“同样的开球状态，只要中间的‘路径’稍微有点不同，终点就天差地别。”
林允宁放下球杆，看着程新竹。
“构象异质性’不是需要被消除的噪声，它本身就是蛋白质错误折叠‘路径”
的痕迹!我们一直想看清终点，却忘了去记录过程。”
程新竹的眼睛亮了。
她快步走到台球桌旁，拿起一颗红球。
“我懂了......所以，我们不应该把几万张图叠加平均，那会抹掉所有的路径信息。
我们应该把它们......串起来?”
“对。”
“但这怎么做?"
程新竹的眉头又皱了起来，“每一张图都是一个独立的快照，我们怎么知道哪一张在前，哪一张在后?它们之间没有时间顺序啊!”
“所以我们要放弃‘重建”
的思路，”
林允宁领着她，走到旁边一台老旧的桌面足球机前，“我们要‘计算”
。
’
他拨动了一下红方的小人，塑料小球在小小的绿茵场上滚动。
“我们不需要知道每一帧画面的顺序。
我们有物理规律。
我们可以建立一个能量模型，把所有可能的蛋白质构象，都看作是能量平面上的一个个山谷”
。
蛋白质的折叠过程，就是小球在这个能量平面上滚动的过程。
“我们要做的，不是去拼凑小球最终掉进了哪个山谷，而是用物理学家的武器，去计算出它最可能走的那条下山路径”
。
从健康的‘山顶，到病变的‘谷底，能量最低，最省力的那条路。”
林允宁的声音不大，但每一个字都像锤子，敲在程新竹的心上。
“这......这是计算生物学的范畴了。”
程新竹喃喃自语，“这需要巨大的计算量，而且......我们怎么知道那个能量模型是对的?”
“这个我来想办法，”
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