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不过，只要深入细致、系统地分析研究这些资料，除了可以发现纳西族先民社会最初是被巫鬼笼罩之外，从中也可以发现，医药最初是和巫术混杂在一起的。
这就需要我们以科学探索的精神，在那些鱼目混珠的资料中，辨其真伪，从中探索出原始科学、合理的部分来。
事实上，在那些庞杂的东巴经资料中，包含着在原始宗教、原始巫术笼罩下对疾病认识的合理内容。
此举两例可以说明。
还是《古署吕》（病因卜）这部经书，在谈到人于属蛇日生病时，除认为是有“鬼”
作祟于人之外，还认为“是饭与水作怪”
。
本书在用“九宫数”
占卜疾病中还谈到，“当天的九宫数占五个那年，庄稼会不好，人间会发生相杀的事，长角的动物会生病”
，“天的九宫数为六那年，地上的麦子会生病，会发洪水，生蹄的动物和人类会生病”
等等。
这显然是把疾病归结于某种原因，认为人因饮食不当（吃饭、喝水）可能造成人体不适或生病。
用“九宫数”
占卜天事人事，属迷信说法，但说因大地上庄稼生长不好，或发生洪涝、旱灾，于是引起人类乃至动物生病，甚至发生残杀，这是有合理因素的。
更可贵的，在《庚空都知绍》这部经书中，有一段对于古时部落争战的记述，其中讲到“肯子短由”
这个人被杀死时说：“肯子短由”
被杀后，“心上三滴血，三滴做变化，变成了千千万万跳蚤和臭虫，变成千千万万的苍蝇，……给人类发生白症和黑症疾病，使人割肉皮一样疼，会使人的声气哑住，……这样无缘无故会使人生病”
。
对这类记录，过去人们不大注意，更不会去从疾病、医药的角度加以理解，还以为这是东巴们讲述的神话和传说。
其实，它反映了纳西族的疾病观，讲的是血、腐烂、污浊，繁生蛆虫、苍蝇、臭虫之类，这些害虫刺吸人或动物血液，使人痛痒，并衍生、传染各种各样疾病。
这是唯物主义和科学的疾病观，值得加以认识和总结。
2．对“巫”
的怀疑和批判
在纳西族中，曾经经历过那么一个过程，即在原始“巫”
、“桑尼爬”
乃至东巴经师也不能用神鬼巫术祛除疾病痛苦的情况下，人们对所谓送鬼、压鬼、驱邪、招魂之类治病的方法逐渐产生了怀疑。
这方面的内容，这里也只能作提要性的研究。
关于纳西族先民对鬼神、招魂之类治病的怀疑，最早出现在占卜病因并用鬼神解释疾病中，当时纳西族先民一方面相信鬼巫，认为病因是鬼邪；但另一方面，也看到祭献鬼神、除魔压邪不是治疗疾病的惟一方法，而必须在行巫的同时，也求医药治病。
这一点就连专事与神鬼沟通的东巴经师也不得不承认。
因此，东巴经师在用海贝为人占卜病因的过程中，在告诉病者因由某种鬼灵作祟而生病，需要祭祀某种鬼灵时，也告诉病者要“服药”
。
《如天高之卜书》中就有这种例子，在占卜生病者是因“中蛊”
而生病时，就告诉病者“宜禳之”
，同时“宜服良药”
，（注：陶云逵：《麽些族之羊骨卜及卜》，130页，载《人类学集刊》，第一卷第一册，1937。
）才能治疗疾病。
在另一部卜书中，在卜出人生病是因为某种神灵被“秽气所罩”
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